于是，王式对裘甫的使者说：“裘甫亲自负荆束缚来这里，我们将免他一死。”接着，王式率兵进驻越州，与郑祗德办理政权交接手续，并为郑祗德摆酒送行。
王式抱歉地说：“我现在正主持军政，不可以饮酒，监军和众宾客不同，完全可以一醉方休。”
到了晚上，继续点灯喝，王式笑着说：“有我在这里，贼兵不敢妨碍你们喝酒，你们一定要尽兴呀！”郑祗德出发的那一天又摆了一次送行酒。
送走郑祗德后，王式开始整顿军纪，那些说军饷不够的人没有声音了，装病在家的人都溜回来了，要求先升官再打仗的人也不敢说话了。
起义军的将领洪师简、许会能率部投降。
王式说：“如果你们是真心投降，应当去戴罪立功，报效朝廷。”
于是任命他们率领自己的部下为前锋，与起义军作战。有功的便上奏朝廷封官。
以前起义军的间谍进入越州，越州都隐匿他们并给他们饮食。文武将吏也有很多人暗地里和起义军私通，希望城破的时候，免除自己一死以及保全妻儿的性命。有的人竟然引间谍假装投降，实际是让他们刺探军情。越州城里连私下闲谈，贼兵都知道的一清二楚。王式觉察到这种情况后大为震怒，派人去明察暗访把所以私通敌寇的人都斩了。白天黑夜街上巡逻得都很严密，这样贼军再也不知道官军的虚实了。
王式又命令各县开仓赈济穷人。
有部将说：“贼军还没有消灭，军队粮食很紧张，不应该发放粮食啊。”
王式说：“这个道理你们不懂。”
又有人说，官军骑兵很少。
王式说：“吐蕃和回鹘流亡到江、淮的人很多，他们习惯了骑马射箭，可以招来利用。”
于是，从附近各地找来骁勇强健的吐蕃人和回鹘人，总计有100多人。这些少数民族人流亡很久，都很穷困。王式犒劳他们一顿后，发放物资资助他们的父母妻儿。众番人都感动得哭泣跪拜，表示愿意为王式而死。王式把他们都作为骑兵，由骑将石宗本率领。
王式又上奏朝廷，求得皇家龙陂监牧马200匹，这样浙东的骑兵就够了。
有人建议兴建烽火台，用来示警敌人的远近众寡，王式笑着而没有答应。
王式又选胆小力弱的人乘健马，少发兵器，作为后备骑兵。众人都很奇怪，因为一直以来很多疑问王式都没有明言，所以众人这次也不敢问了。
王式在校场检阅各地官军和地方武装，总共有4000多人。让他们各找向导领军分路讨伐起义军。当时浙东府已经没有守兵了，王式从本地武装中挑1000人补充。然后，命令宣歙军主将白琮、浙西军队主将凌茂贞各率领本部人马，韩宗政等北边来的将领率领本地地方武装1000人，石宗本率骑兵为前锋，从上虞进军奉化，去解象山之围，号称东路军。又以义成军主将白宗建、忠武军主将游君楚、淮南军主将万各帅本部人马与台州唐兴的军队合为一起，号称南路军。王式严令诸将领：“你们不要挑选进军路线的险易，务必急速进兵。切勿焚烧老百姓的房屋，不要杀平民充当敌人的首级！缴获贼兵的金银财宝你们留着自己用，官府不过问。俘虏的敌人如果越州人，一定要释放他们。不遵命令者，严惩不贷！”众将都应和说好，一切都严格照办。
不久，南路军攻破沃州寨和新昌寨，大败贼将毛应天，进抵台州唐兴县。
五月，浙东东路军大败贼将孙马骑于台州宁海县。而南路军大破贼将刘、毛应天于唐兴县南谷，杀贼将毛应天。
王式还是感觉兵力不足，又上奏要求从忠武军、义成军和昭义军三道再征调兵马，皇上下诏一一听从。三道援兵到越州后，王式命令新到的忠武将领张茵率300人进驻唐兴县，截断贼兵南逃的道路；派义成将领高罗锐率300人，增援台州本地军队，直扑宁海，攻击贼兵的巢穴；昭义将领夹跌率400人，增援东路军，截断贼兵逃入明州的道路。
不久，南路军大破贼军于海游镇，贼兵躲入甬溪洞。
官军驻扎于洞口，贼军出战后又被官军打败。高罗锐率军偷袭贼军别帅刘平天的营寨得手。至此，从王式下令出征以来，诸军与贼军作战十九次，贼军十九连败。
刘对裘甫说：“如果以前听我的话全力攻破越州，怎么会有今天的困境呢？”
王辂等进士在贼军中，都穿绿色的官衣，刘把他们都斩了，说：“乱了我计谋的人，都是这些青色的虫子！”
不久，高罗锐率军攻克宁海，收录逃散的农民，得到7000多人。王式说：“贼军已经陷入困境并且缺少粮食，一定会逃入大海，进了大海则不是短时间能消灭的。”
于是，命令罗锐率军在出海口防备。又命望海镇将云思益、浙西将领王克容率水军在海上巡逻。思益等遇贼将刘从简从宁海往东而来，刘从简军没想到官军的水军突然赶到，都弃船逃奔山谷。官军缴获敌船十分之七，并把这些船都烧毁了。
王式说：“贼军现在快无路可逃了，只有黄罕岭可以进入剡县，只可惜我已经没有军队可以派到那里去防守。虽然贼军能逃到剡县，不过也早晚会被我们捉拿！”
裘甫在宁海失败后，率军屯扎在南陈馆，还有10000多人。东路军破贼将孙马骑于上村，贼将王皋害怕主动请降。接着浙东东路军大破裘甫于南陈馆，杀1000多人，贼军将丝帛丢得满地，以延缓官军的追击。夹跌对士兵说：“有敢捡丝帛不前者，杀无赦！”没有一个士兵敢看地下的物品，都奋勇追击。敌人果然从黄罕岭逃走了。
六月，贼军又进入剡县。诸路官军都不知道裘甫在哪里。义成军将领张茵在唐兴抓获一个俘虏，正打算严刑拷问他，俘虏说：“贼军已近进入剡县了。如果你们放了我，我愿意为你们做向导。”
张茵答应了他，率军比裘甫晚一天到剡县，驻扎在剡县城东南，越州浙东府人听说裘甫又来了越州剡县，都很惊恐，王式说：“贼军到了我们这里，正好来个关门打狗！”立即命令东、南两路军会师于剡县，不久就将剡县团团包围。贼军防备很完善，久攻不下，诸将商议后决定断溪水让敌军无水可喝，贼军知道后，被迫出战。三日内，大小打了83次，贼军都败了，官军也很疲劳。贼将请求投降，诸将询问王式，王式说：“贼军是想休息下再打，你们要更加小心防备，要不然就功败垂成了。”
果然，贼军又出来挑战，两军又大战了三场。到了晚上裘甫、刘、刘庆带100多人出城来谈投降的事宜，远远地与王式诸将对话。王式说你们过来点，我们听不到，等裘甫等人离城门有几十步时，官军突然冲过去断了他们的后路，把他们都擒获了。刘等人大骂王式卑鄙小人，言而无信，突施暗袭。王式冷笑不耻，并不言语。
王式把裘甫等人押到越州，腰斩了刘、刘庆等20多人，然后用囚车将裘甫送往京师。当时剡城还没有攻下，诸将认为裘甫已经抓获了，就放松了警惕。刘从简率500人突围逃走了，诸将追到大兰山（今浙江余姚南），刘从简据险坚守。
七月，诸将一起将大兰山攻克，台州刺史李师望出榜说，叛乱的士兵可以拿另一个士兵的头来赎罪。这样，贼兵人人自危，立马有几百人率先杀了自己的同伙来投降官军。刘从简的部下也杀了他，拿着他的头献给官军。各路官军终于凯旋而回越州。
王式为众将大摆庆功酒宴。诸将在酒席上问：“我们在军中也呆了很长时间了，军队中的事情都很熟悉。但是自从今年得以跟从王中丞征讨贼军以来，私下有很多事情还没弄明白！请问：当时军队正缺粮，为什么还要散粮赈济灾民？”
王式回答说：“这个道理很简单。贼军聚集稻谷就是为了引诱饥饿的人作乱，我给他们食物，那么他们就不会去投奔贼军；况且各县没有士兵防守，贼军到了，仓库里的粮食正好成了贼军的军粮，还不如发给老百姓！”
众将又问：“为什么不置烽火台？”
王式回答说：“点烽火是为了招救兵，我已经把军队都派出去了，城中没有士兵可以再支援了，这样只会惊扰士民，让我们自乱阵脚。”
又有人问：“让懦弱的士兵做后备骑兵而少发兵器，这是为什么？”
王式说：“勇猛的士兵都拿着尖利的兵器，遇到敌人自然会尽力相斗，后面骑兵只是为了壮我军声势，威吓敌人罢了；只怕敌人到死都不知道这个秘密。”王式得意地哈哈大笑。
众将都佩服得五体投地说：“这不是我们想得到的，太厉害了！”
八月，裘甫押到京师后，斩首于东市。朝廷加封王式为检校右散骑常侍，诸将也各有封官赏。以前，皇上天天为越州的叛军担忧，夏侯孜对皇上说：“王式才华横溢，用不了多久就会告捷。”夏侯孜写信给王式说：“你专心剿灭裘甫的叛乱，有任何要求，我们都尽量满足你。”之后但凡王式有上奏，朝廷都一一答应，这也是王式能迅速剿灭裘甫的原因。